Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT17Q9BSW7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYT17Q9BSW7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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