Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOPXQ9BPY8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms