Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDRT15Q96T59 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms