Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A2Q96QD8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms