Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC9Q96Q05 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms