Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NLRP3Q96P20 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP3Q96P20 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms