Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRRC1Q96M27 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRRC1Q96M27 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms