Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SAMD8Q96LT4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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