Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRIQ1Q96JM4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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