Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC97Q96F63 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms