Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HDAC11Q96DB2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HDAC11Q96DB2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms