Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NMD3Q96D46 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms