Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C8orf44Q96CB5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms