Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP4Q969X6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms