Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRG4Q92954 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG4Q92954 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms