Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TOPBP1Q92547 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TOPBP1Q92547 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms