Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GIPC3Q8TF64 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms