Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIEQ8NEW7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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