Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZIC4Q8N9L1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms