Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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