Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD35Q8N283 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ANKRD35Q8N283 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms