Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLRP13Q86W25 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLRP13Q86W25 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms