Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms