Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMARCD3Q6STE5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms