Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF7Q6Q0C0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF7Q6Q0C0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms