Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNS3Q68CZ2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms