Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms