Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFT2D3Q587I9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFT2D3Q587I9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms