Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC153Q494R4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC153Q494R4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms