Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC27Q2M243 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC27Q2M243 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms