Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL24A1Q17RW2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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