Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRNQ16849 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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