Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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