Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNAPC1Q16533 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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SNAPC1Q16533 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNAPC1Q16533 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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