Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNGA3Q16281 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNGA3Q16281 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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