Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
USF2Q15853 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
USF2Q15853 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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