Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms