Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIP10Q15642 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms