Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHBQ15464 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHBQ15464 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms