Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK5R1Q15078 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK5R1Q15078 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms