Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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BRD3Q15059 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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