Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIXQ14938 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NFIXQ14938 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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