Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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ERV3-1Q14264 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERV3-1Q14264 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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