Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRIM25Q14258 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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