Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CBFBQ13951 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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CBFBQ13951 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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CBFBQ13951 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CBFBQ13951 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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