Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE7AQ13946 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PDE7AQ13946 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE7AQ13946 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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