Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DDX39BQ13838 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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