Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXE3Q13461 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXE3Q13461 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXE3Q13461 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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FOXE3Q13461 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXE3Q13461 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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FOXE3Q13461 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXE3Q13461 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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