Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD1Q13393 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms