Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLAMF1Q13291 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms